다차원척도법에서 이용되는 자료의 형태로는 n×n 인 비유사성 행렬(dissimilarity matrix) D = (dij) 또는 유사성 행렬 (similarity matrix) C = (cij)를 들 수 있다. 일반적으로 이 행렬들은 직접 관찰되기도 하지만 대개 자료행렬 X=xir , i=1,…, n ; r=1, …, p 로부터 구해야 한다.
비유사성이라 함은 p-차원 공간의 개체 i와 j의 좌표점 xi=(xi1, … ,xip)t 와 xj=(xj1, … ,xjp)t 의 거리를 나타낸다. 비유사성을 측정하는 거리는 다양하게 제시되어 있지만, 이들은 (1) dij ≥ 0, i ≠ j ; dii = 0 , (2) dij=dji (대칭성), (3) dik+djk ≥ dij (삼각부등식)와 같은 조건을 만족해야 한다. 여기서, (3)은 반드시 필요한 것은 아니다. 왜냐하면, 대부분의 거리들이 이 조건을 만족치 않기 때문이다. 하지만, 유클리드 거리는 모든 조건을 만족한다고 알려져 있다. 자주 사용되는 거리의 공식으로는 다음의 세가지를 들 수 있다.
① 유클리드 거리 (k=2 인 민코스키 거리)
